Rola czynników infekcyjnych wewnątrz powstawaniu alergii jest dwuznaczna. Z jednej strony zaobserwowano częstą korelację pośrodku przebytą infekcją (zwłaszcza wirusową) dróg oddechowych i nabyciem nadwrażliwości na alergeny wziewne. Z drugiej strony podkreśla się profilaktyczny wpływ wielu czynników infekcyjnych na występowanie alergii. Protekcyjny wpływ wykazano jednoznacznie w środku przypadku zakażenia wirusem odry, WZW B również mikroorganizmów (np. prątki gruźlicy) zwiększających wysokość subpopulacji limfocytów Th1, które działają antagonistycznie wewnątrz stosunku do proalergennych limfocytów Th2. W przypadku odry istotna prawdopodobnie egzystować długotrwała immunosupresja oraz ułomność funkcji limfocytów T następujące po przebyciu zakażenia. Natomiast infekcje dróg oddechowych, najprawdopodobniej na wskroś zredukowanie szczelności nabłonka, umożliwiają większą penetrację antygenów, prowadząc w środku konsekwencji do wzrostu ryzyka alergizacji. Ze względu na powyższe dowody, wymiary naukowców lansuje hipotezę, wg której obserwowany współcześnie zwiększenie częstości występowania alergii jest ceną, jaką płacimy zbyt sanitarny zwyczaj życia także zbytnio zwalczanie tudzież kiedy niekiedy całkowite wyeliminowanie niektórych chorób zakaźnych.
Częstotliwość występowania wielu chorób o podłożu alergicznym wewnątrz tym m.in. astmy oskrzelowej wzrasta od czasu zakończenia II Wojny Światowej. Obraz ten koreluje z wprowadzeniem do powszechnego użycia antybiotyków także wzrostem dobrobytu do wnętrza krajach zachodnich. Część badaczy uznaje to zbytnio konfirmacja teorii higieny.